Szekvenáló berendezés

A coronavírusok emlős rezervoárjai – vírus diverzitás és gazdaspektrum

Azonosító
OTKA FK143375
Témavezető
Kutatás éve
2022 - 2026

A coronavírusok világszerte elterjedt, humán- és állategészségügyi szempontból jelentős ágensek. A coronavírusok genomja mutációra hajlamos, ami a gazdaváltás tekintetében kedvező tulajdonság. A közelmúltban leírt járványos esetek, köztük a jelenleg tartó SARS-CoV-2 világjárvány kapcsán az állatról emberre terjedő, zoonotikus coronavírus fertőzéseknek nagy figyelmet szentelnek. Egyre több adat lát napvilágot az emberről állatokra történő, a házi kedvenceket, haszon- és vadállatokat érintő reverz zoonotikus átviteléről is. Emellett számtalan, emlősöket és madarakat (például sertést és baromfiféléket) fertőző, nagy gazdasági jelentőségű coronavírust ismerünk. A tervezett pályázat keretein belül egy olyan emlős coronavírus specifikus, univerzális diagnosztikai rendszert hozunk létre, amely a vírusok egy genomszakaszának felsokszorozása mellett azok szekvenciájának meghatározására alkalmas, azonosítva a szóban forgó vírustörzs(ek) taxonómiai hovatartozását. A módszer segítségével eddig ismeretlen coronavírus genotípusok és új gazdafajok is azonosíthatóak. A coronavírusok előfordulásának felmérésére házi- és vadállatokból származó (többek között sertés, denevér, kutya, macskafélék, vadászgörény), valamint szennyvíz mintákat dolgozunk fel. Az új adatok függvényében továbbá teljes coronavírus genom szekvencia meghatározást tervezünk. A coronavírus fertőzések időben történő felismerése globális jelentőségű; a coronavírusok genetikai tulajdonságainak jellemzése, változásának követése a nemzetközi járványügyi vizsgálatok és kutatások alapját képezi, amelyre a védekezéssel kapcsolatos intézkedéseket építhetjük.